随着当前农牧业信息化的不断深入开展，如何利用信息技术来提升工作效率已经非常迫切，为了更好地完善内蒙古畜产品质量中心认定认证工作，提高认证效率和管理水平，中心主持开发了“三品一标”认证认证查询管理系统。
系统把无公害农产品、绿色食品、有机食品、地理标志产品的认定、认证纳入统一管理，分为业务受理系统和受理查询系统两部分，业务受理系统包含登记管理、认证审核、认证查询、系统管理、个人设置五个主要模块，中心各科室和业务部门根据不同的权限享有登记、审核、查询、设置等功能。企业可以进入受理查询系统，通过受理编号查询产品认定认证进程及认证过程中中心工作人员的各种通知，如补充材料、现场检查通知、交费通知等。
随着系统的不断完善，后续还将加入统计报表、产品到期提醒、认证量化考评系统等，必将极大的促进中心的工作。