根据《江苏省食品生产协会章程（草案）》的规定，协会常设工作机构2个：综合部与信息部。两部门在理事长、副理事长领导下，由组织实施、开展工作。
1、综合部的职责：
负责人事、财务、行政管理，办理各项社会保险手续及有关证件的注册、登记、变更、年检等手续。负责整理协会相关资料；负责组织会员交流和培训。指导会员相关知识，包括当前食品面临的严峻性及其危害分析、相关行政许可要求、监督管理办法等，参与制定江苏省食品生产协会运营的各项制度。面向江苏省各食品企业单位开展培训讲座，及协会交办的其他其他工作。
2、信息部的职责：
负责策划方案，作协会有关活动的详细计划；负责协会后期工作的总结与分析工作，将分析报告提交给各部门作为学习资料，对目标完成情况进行考核；负责建设和维护协会门户网站，编辑会刊和搜集相关资料。负责建立资源库，广泛收集各食品企业单位行业动态及需求，组织开展各企业单位的行业交流活动，及协会交办的其他其他工作。