饮料行业的发展离不开新技术的投入和应用。在开发不同原料的饮料过程中，需要应用不同的高新科技来确保优良的产品品质，如康复饮料中纤维素的选择和应用，豆奶加工过程中营养的保存和风味的改善，货架寿命的延长等。
酶技术克服了传统化学转化所需要的高温、高压条件，在平常的条件下即可以达到理想的加工效果。例如在果汁澄清时，添加果胶酶可降低果汁粘度，并使混汁液澄清。酶还能破坏果汁中悬浮物的稳定性，使其凝聚并沉淀下来。当向果浆中加入酶类物质时，则胶凝结构逐渐消失，粘度降低，果汁就可提取出来。对于制作带有果肉的果蔬汁饮料，应使用果胶解聚酶液化果蔬中的可溶性果胶，从而使果蔬汁保持一定的粘度，这时应避免果胶脂酶过度的果胶链结构的作用，否则会导致果汁粘度过低。针对不同的产品特点和包装要求，选择适合的酶制剂和工业应用条件可以帮助饮料行业减低产品成本，提高利润率。
近年来在食品工业中得到广泛应用的薄膜分离技术包括反渗透、超滤、微滤等。薄膜过滤的原理是在薄膜一侧加压，使得比薄膜孔径小的分子通过，而较大的组分被截留下来。微滤可以分离体积在0.02~2.1μm之间的微小物质和悬浮的固体，可以除去淀粉、细菌等。在果汁工业中采用微滤技术除去使成品果汁模糊不清的果胶，使用薄膜过滤的果汁成品的成品率可达95%~98%,而传统过滤方法不但步骤繁琐，包括保温、离心分离和过滤等工序，而且成品率只有90%.超滤可以分离比微滤还小的不溶物质，它的分离范围在0.02~0.2μm之间。超滤可以在低于5×105Pa的条件下操作。用超滤薄膜可以过滤出蛋白质、脂肪、病毒和色素等物质。反渗透能阻止比2.5×10-22m大的离子或分子，允许水从高浓度流体向低浓度方向渗透。膜技术现已在我国饮料行业中得到了广泛应用，为我国饮料包括矿泉水的质量提高和出口创汇做出了极大贡献。
高新科技在饮料工业中的应用使得针对特定消费人群的功能性饮料的生产成为可能，不同消费人群对功能性饮料的认可又促进了高新科技在饮料产品中的应用。中国有3.5亿儿童，在我国国家食物与营养咨询委员会及有关营养专家的呼吁下，我国中、小学生营养午餐计划有了可喜发展，其中的一个重要内容是豆奶和牛奶等蛋白质饮料。适合儿童的高质量饮料有利于我国未来人口素质的增强。到2000年，我国老年人口将占总人口总数的8.9%,约有1亿老人。老年人的基础代谢降低，生理功能减退，循环系统功能改变，适合老年人的饮料要解决平衡营养素成分、增加特定功能性成分、清除氧自由基的问题，同时还要考虑老人的口味需要。拥有现代高科技技术，把握市场消费需求。