一、表面净化：首先把鲜叶用清水漂洗干净，最好用深井水，不能用含漂白剂的自来水，因漂白剂可导致芦荟液变色、变质。
二、紫外辐射杀菌：洗干净的鲜叶，晾干后，运入无菌室（室内装有杀菌消毒设备），进行紫外辐射杀菌，一般5至10分钟即可。
三、去掉叶皮：在无菌室内进行，芦荟去掉叶皮，用消毒的刀片割开外皮，并将芦荟凝胶取出。将凝胶和叶皮分别装入塑料（10115,-165.00,-1.61%）桶或缸内。
四、高速粉碎与沉淀：用高速粉碎机把凝胶和叶皮组织捣碎，成为稀浆液。然后用高速沉淀机进行沉淀处理。之后进行过滤或真空过滤，即成为芦荟纯原汁。虑取芦荟原汁后的虑渣数量不多，约为芦荟鲜叶重量的2%-4%,此渣可加水煮1小时，虑取其汁，该方法为芦荟炼汁。芦荟炼汁直接加热浓缩至饴糖一样的浓度，冷却后凝成树脂状，即为中药芦荟。
凝胶和叶皮处理后的原汁用途不同。凝胶原汁主要用于饮料、食品或添加剂等。叶皮原汁则主要用于护肤、护发化妆品和制造药品等。