为了进一步做大做强高邮鸭业经济，宣传高邮、宣传高邮鸭，扩大对外度，以进一步弘扬高邮鸭业，传承鸭业文化、艺术。把产品加工和全市鸭业经济紧密结合，把高邮鸭的历史、文化、艺术、美食、营养、加工、科技、品牌、产业化以及人物与领导关怀等重大史篇融为一体，向社会集中展示。2010年8月，高邮市委、市政府决定筹建“鸭文化博物馆”,通过广泛考察调研和论证、设计，并于2010年10月上旬破土动工，2011年4月15日峻工开馆。
该博物馆占地面积1.2万平方米，其中核心展区1800平方米，总投入为2480万元。整体设计风格是田园牧歌，空间总体布局上按内容划分为序厅和4个主展厅：展厅“华夏牧鸭冠”:第二展厅“高邮麻鸭甲天下”;第三展厅“名鸭产业惠四方”;第四展厅：“鸭韵醉人耀中华”.
本馆筹建工作得到了国家农业部、省农委、农科院家禽研究所、上海农科院、南京农业大学、扬州大学等许多高等院校、科研单位的支持。截止2014年5月，该馆已先后接待国内外来宾3万多人，深受海内外宾朋一致好评。