2011年12月31日上午10时30分，绿色农业联盟成立大会在北京召开。绿色农业联盟的倡议人、发起单位、联盟筹备委员会和专家委员会代表及新闻媒体代表等近百人参加了会议。联盟成立大会由联盟筹备委员会宋典元主持，1993年世界粮食奖获得者、农业部原部长何康同志到会祝贺并讲话，绿色食品和绿色农业创始人刘连馥先生代表联盟筹备委员会发表了热情洋溢的讲话。，由农业咨询团主任、工程院原副院长卢良恕院士为绿色农业联盟揭牌。
绿色农业联盟是在1993年世界粮食奖获得者、农业部原部长何康同志，农业咨询团主任、工程院原副院长卢良恕院士，科技部原副部长韩德乾教授，科学院李文华院士，工程院汪懋华院士等德高望重的老领导、老专家的倡议下，由农业机械化科学研究院、绿色农业公司、扶贫海外劳务项目管理中心、中绿联合（北京）农业科技推广中心、北京丰泰艾兰农业科技有限公司、河南长远集团、北京后稷绿色农业经济技术研究所等单位共同发起成立的。联盟的主管单位是民营企业合作发展促进会。
2003年10月，在亚太经社理事会主持召开的“亚太地区绿色食品与有机农业市场通道建设研讨会”上，首次提出了绿色农业的概念，得到了亚太经社理事会官员和与会代表的高度认同，并决定由筹备绿色农业联盟。经过两年时间的调查、研究、总结，奠定了绿色农业概念的理论基础。绿色农业是指运用先进科学技术、先进工业装备和先进管理理念，以促进农产品、生态、资源和提高农业综合经济效益的协调统一为目标，以倡导农产品标准化为手段，推动人类社会和经济、协调、可持续发展的农业发展模式。
2005年5月26日，回良玉副对卢良恕、关君蔚等6位专家提出的《关于绿色农业科学研究与示范基地建设的建议》做出重要批示，指出：绿色农业的研究和示范工作，是探索以新的发展模式和新的经营理念来促进农业发展，提高农产品竞争力的实践。望科学安排，精心组织，以取得实效。
绿色农业理念与党中央、提出的走特色现代农业发展道路是一致的。“绿色农业是当前现代农业发展的主导模式”，成为许多业内人士的共识。应该说，绿色农业已经纳入了我国农业发展的主旋律，影响着我国农业走向绿色发展之路，也是世界农业发展的必然趋势。因此，绿色农业联盟的成立，是我国国民经济和农业发展的历史必然。
刘连馥先生表示：绿色农业联盟以倡导、协调、可持续发展为基础，以推动先进的农业发展模式为宗旨，以促进农业产品、生态、资源及综合效益提高为目标，通过组织公益性事业及商业性经济协作，实现对三农事业和构建和谐社会提供有效的服务。联盟将遵守国家法律、法规，并在坚持联盟自律的基础上开展相关的业务活动。绿色农业联盟对大家的要求很高，要成为一个的、合格的绿色农业工作者，就要具备较高的综合素质，包括水平、前瞻性的理念和思维方式。我们要在实践中努力提高思想水平和工作水平。世界本来就是绿色的，农业也应该呈现“绿色”。我们倡导的绿色农业，是一万年农业历史的结晶，也是当代进科技的凝华。让环境返璞归真，让农业与时俱进，让人类持续发展，这是政治家的理想，是老百姓的理想，也是我们每一个绿色人的理想！