食品行业里面，发酵技术的应用非常的广泛，在行业的快速发展中，也需要新的技术不断地推动市场的进展。
利用生物技术开发各种新型发酵剂、食品配料和食品添加剂。提高现有酶的催化效率，在极端条件下（如沸腾温度）应用并具有快速失活的能力；开发在非水环境下应用的酿制剂以及复合酶；开发防腐剂、保鲜剂、色素及稳定剂等；利用蛋白质工程选择性改变蛋白质结构（表面疏水性或蛋白质稳定性），显著改善其功能性质（凝胶形成能力、起泡性二乳化性及持水性）；如采用基因技术和传统方法相结合进行蛋白质结构的改性。
我国在这些领域中有些研究正在进行中，如已采用基因克隆和高效表达等技术获得一种新的乳糖酶，成功地开辟了乳糖酶高效生产的新途径。，新型高效分离技术膜分离技术包括微滤、超滤、纳滤及反渗透，常用的膜材料为有机合成膜、陶瓷膜和不锈钢膜。目前膜分离技术已广泛应用于我国食品工业，例如果汁（澄清果汁和浓缩果汁）、酒类、乳制品（分离乳清蛋白）加工以及功能性成分的提取。我国已成功使用膜分离技术并与工业色谱技术结合，在中试规模上从牛初乳中提取纯度较高的医药级、食品级和工业级的乳铁蛋白，将三种分子量非常相近的活性蛋白（免疫球蛋自、乳铁蛋自和乳过氧化物酶）完全分离。
在行业的韩各样的发展中，一定要有新的技术，不断地推动行业的快速进步，新的发酵剂无疑是很重要的突破口，在市场上面，也将带动行业有新的突破。