由于供水中间层的存在，深圳目前在自来水供应上还存在“同城不同价”的问题。记者从深圳水务部门了解到，为减轻用户负担，供水企业正加快中间层接收进度，明年特区内供水将全部抄表到户。
供水中间层包括物业管理单位、股份公司等机构。由于部分供水中间层管理制度混乱，存在不按有关规定的标准收取水费，私自抬高水价，将小区内因管网漏损以及总表与分表之间的差价非法转移给居民的行为。深圳市水务局要 求特区内供水企业在2007年7月之前完成全部中间层接收工作；宝安、龙岗两区于2009年7月底前全部完成。
到目前为止，招商、光明、坪山、大鹏、核电等自来水公司辖区内中间层已全部接收完毕；负责特区内供水任务的水务集团则表示，有望今年年底前提前接收完毕。