为加强水产科技工作者的科技创新，促进学科融合与现代渔业和谐健康发展，2009年11月10日—12日，水产学会主办的2009年水产学会学术年会在海南省海口市寰岛泰德大酒店召开，本届年会主题是“科技创新与现代渔业”。大会开幕式由水产学会副理事长、科学院水生生物研究所研究员桂建芳主持，水产学会副理事长兼司徒建通研究员，副理事长、海洋大学副校长董双林教授，副理事长、上海水产大学副校长黄硕琳教授，副理事长、集美大学副校长关瑞章教授，副理事长、广东海洋大学副校长吴灶和教授等出席开幕式。水产学会副理事长兼司徒建通研究员代表水产学会致辞。水产学会副理事长、上海海洋大学副校长黄硕林宣读了《关于表彰2008年水产学会学术年会论文的决定》，共向45篇论文年会论文获奖者颁发证书。
开幕式后，举行了大会主题报告。水产科学研究院黄海水产研究所王清印研究员、中科院水生生物研究所桂建芳研究员和水产科学研究院信息与经济研究中心杨宁生研究员分别做了题为“再论发展生态系统水平的海水养殖业”、“银鲫育种的理论基础与实践价值”、“Fish—Base 世界鱼类信息的重要研究工具”的大会学术报告。
此次学术年会共有来自各地专家、学者、水产科技工作者、研究生等520人参加，共设有水产健康养殖、水产种质资源保护与良种选育、渔业经济及水产动物营养与饲料、水产品加工与质量、渔业资源与环境等5个专题，口头报告交流180篇。