几年前的“三鹿事件”是我国的牛奶销售以及奶牛养殖面临之的挑战，经过这几年乳企的不断努力，我国乳业在技术装备水平、检验检测能力科研创新水平等方面都有显着提升。但是，在乳业巨头的冲击下，面临“不进反退”的危机。
除国产乳粉销路不佳外，良种繁育体系不健全、牧业人才匮乏、生产和流通成本高等因素更是成为当前制约我国乳业发展的瓶颈。
国内奶牛配种退化
近年来，我国奶牛总体质量较差的面貌仍没有得到根本转变。目前我国真正的良种高产奶牛数量仅占奶牛存栏总数的1/5,奶牛平均单产量为5吨，仅是美国的1/2左右。
“好牛下好犊，好牛产好奶。使用奶牛进口冻精繁育的犊牛，在遗传性能、生长发育、产奶数量及质量、基因血缘等方面都要优于传统方式繁育的奶牛。”内蒙古锡林浩特伊利牧业发展有限公司场长万兆会说。
在乳业协会副理事长、育种委员会主任张沅看来，与发达国家相比，我国在奶牛品种遗传素质和选育技术上还有很大差距：一是奶牛品种改良工作指导思想不明确，缺乏稳定的育种目标。基层牧场和牧民存在“不选种，不选配，重表面，轻数据”等问题。二是始终未建成规范的良种奶牛繁育体系，生产性能测定、后裔测定、品种登记等工作流于形式，甚至不少地区记录数据存在造假行为。三是奶牛群体遗传改良体系不健全，机制不完善，迄今尚未形成自主培育和选育种公牛的能力。
高端人才每年缺口超
我国畜牧业优化升级需要大批养殖、防疫、饲料加工、食品机械维修、市场营销等一系列人才。据不完全统计，我国畜牧兽医行业高端技能型人才每年缺口在70%以上。
《广东省畜牧业“十二五”发展规划》显示，“十二五”期间，广东省畜牧业每年需新增技术人员1万人以上，广东省现有畜牧兽医技术人员2万多人，其中系统掌握养殖和疾病防治技术的操作技能型人才仅占30%左右，其中大专以上学历的比例不足10%,有近1.5万人需接受再培训。
在山东省高校毕业生畜牧兽医类2013年就业招聘会上，国内外600多家畜牧企业提供了2.2万个岗位，应聘者与岗位需求达到1∶7.即使涉农企业开出的条件很诱人，不少应届毕业生还是选择了离开。郑州牧专毕业生王然说，养殖场大多在偏僻的郊区，工作封闭，很少与外界沟通，不到半年他就辞职了。
“农产品的生产周期长，从事农牧业首先要耐得住寂寞。”河南农大招生就业处处长张留湛说，该校每年涉农毕业生1000多人，选择就业的学生中，大部分人仍将留在大中城市作为就业。
内蒙古锡林浩特市农牧业局副局长乔振国认为，当前我国畜牧业人才教育存在三大问题：一是畜牧教材更新缓慢，教学内容陈旧，与生产脱节。二是毕业生普遍存在工作能力不强，操作能力不熟练。三是职业素养有待提高，不少学生欠缺正面积极的职业心态和正确的职业价值观，到单位工作不久便跳槽。
国家乳业技术产业体系首席科学家李胜利表示，随着乳业企业的加速整合，缺乏合格的大型牧场管理人员将成为我国牧业现代化面临的重大挑战。
成本高企四成乳品加工企业亏损
社会科学院畜牧业经济研究中心主任刘玉满表示，“三鹿事件”暴露的乳品质量问题，一度掩盖了我国乳业长期以来产业结构扭曲的问题。这两年矛盾开始逐渐凸显。
一方面，我国的奶牛养殖规模程度偏低，一些大型牧场饲养成本偏重，实际利润偏低；另一方面，我国的奶牛养殖成本优势已不存在，收奶价格已大大高出平均价格，这导致了近四成的乳品加工企业处于亏损状态、奶粉越来越依赖进口。
农业部数据显示，2009~2013年间我国主要饲料产品价格呈逐年上升趋势，年均涨幅达10%.其中，作为奶牛养殖为重要的原料，玉米、豆粕价格近年来总体上呈现波动上升的走势。
随着我国工业化、城镇化程度逐步提升，农业劳动力等生产要素成本也不断上涨。据北京农业部门监测，京郊农村劳动力26个农产品品种平均成本由2009年的43元/工日提高到2013年的81元/工日。
在激烈的市场竞争环境下，各企业都不遗余力打造销售渠道，金字塔式的销售模式、返点销售、高强度广告宣传等屡见不鲜。贝因美公司2013年年报显示，营业总利润大幅增长，达61亿元，但归属母公司股东的净利润仅为7亿元；而经销渠道费用竟然高达10亿元。