巴氏杀菌奶是可以加热饮用的，但是温度最好控制在30到35度之间，不能超过40度。巴氏杀菌奶的加热时间越长，温度越高，营养流失越严重。一般情况下，巴氏杀菌奶必须冷藏保存，牛奶的卫生完全可以达到标准，没必要加热。
和巴氏杀菌奶相比，纯牛奶是采用135℃以上的超高温灭菌工艺，使牛奶营养大部分流失。纯牛奶中的钙会因为使用了135℃以上的超高温度，使原先带活性的钙发生焦化，变为不溶性的磷酸三钙，这种不溶性钙很容易被胃酸分解，不被人体吸收。
巴氏鲜奶则避免了这一问题，采用的是75℃到85℃的巴氏低温杀菌工艺，保证牛奶安全的同时最大限度的保留了牛奶中的活性物质和营养，更利于钙质的吸收。另外，研究发现巴氏杀菌奶含有高于常温奶1800倍的乳铁蛋白。
乳铁蛋白能够保护我们的肠黏膜，把进到肠道系统的致病菌和有害菌抑制掉。低温巴氏鲜奶是以杀死致病菌和有害菌为原则，以保护牛奶营养成分的自然存在为目的，所以中国台湾一直走低温巴氏鲜奶的方向。
巴氏杀菌奶不需要加热，既能够达到安全饮用标准，又能最大程度地保留鲜牛奶的营养和风味，在欧美发达国家特别流行。在美国和澳洲常温奶产量只占总量的1%到2%，并仅仅是处于出于运输的考虑，主要是供应给海外驻军部队饮用的。