巴氏杀菌奶的保质期一般在3-7天，需要在2℃-6℃下冷藏保存。巴氏杀菌奶的包装一般采用玻璃瓶、屋顶纸盒等，巴氏杀菌奶不易保存，如果没有时间逛超市，可以选择饮用常温牛奶。
巴氏杀菌奶和常温奶相比新鲜，营养也更全面一些。但饮用牛奶，仍需视每一个消费者不同的实际情形如经济水平或购买能力、购货环境与条件、年龄、饮食与消费习惯、食用或保存方便等因人而异而决定选择的取舍。
巴氏鲜奶以保留牛奶天然营养为目的，采用低温杀菌工艺，具有“纯天然、原汁原味、保持活性”等特点。即将牛奶加热到62~65℃，保持30分钟，灭菌效率可达97.3%~99.9%。同时，巴氏鲜奶对奶源要求极高，必须采用新鲜、安全的牧场奶源，不允许用奶粉还原。
巴氏消毒其实就是利用病原体不是很耐热的特点，用适当的温度和保温时间处理，将其全部杀灭。但经巴氏消毒后，仍保留了小部分无害或有益、较耐热的细菌或细菌芽孢，因此巴氏消毒牛奶要在4℃左右的温度下保存，保质期短，一般3-7天，夏天常温下放4个小时就坏掉了。